#:lav
d {
  "blastz.v7 seq1 seq2
     A    C    G    T
    91 -114  -31 -123
  -114  100 -125  -31
   -31 -125  100 -114
  -123  -31 -114   91
  O = 400, E = 30, K = 3000, L = 3000, M = 0"
}
#:lav
s {
  "seq1" 1 86981 0 1
  "seq2" 1 379801 0 1
}
h {
   "> seq1"
   "> seq2"
}
a {
  s 11077
  b 12531 196749
  e 13166 197390
  l 12531 196749 12547 196765 71
  l 12548 196768 12581 196801 59
  l 12593 196802 12657 196866 63
  l 12659 196867 12706 196914 56
  l 12711 196915 12735 196939 60
  l 12737 196940 12753 196956 71
  l 12760 196957 12769 196966 70
  l 12772 196967 12781 196976 60
  l 12785 196977 12813 197005 55
  l 12814 197008 12841 197035 57
  l 12842 197037 12849 197044 75
  l 12851 197045 12859 197053 67
  l 12860 197076 12870 197086 82
  l 12872 197087 12896 197111 64
  l 12897 197116 12912 197131 38
  l 12913 197138 12939 197164 59
  l 12940 197168 12952 197180 62
  l 12955 197181 12966 197192 75
  l 12968 197193 12978 197203 55
  l 12979 197211 13058 197290 75
  l 13059 197292 13074 197307 69
  l 13081 197308 13090 197317 80
  l 13094 197318 13166 197390 75
}
a {
  s 9522
  b 13466 197377
  e 13789 197690
  l 13466 197377 13487 197398 59
  l 13492 197399 13500 197407 78
  l 13501 197410 13515 197424 60
  l 13516 197426 13543 197453 71
  l 13547 197454 13565 197472 79
  l 13567 197473 13578 197484 75
  l 13581 197485 13597 197501 76
  l 13599 197502 13606 197509 63
  l 13608 197510 13688 197590 63
  l 13689 197592 13772 197675 75
  l 13775 197676 13789 197690 73
}
a {
  s 31317
  b 15060 198768
  e 16127 199757
  l 15060 198768 15088 198796 97
  l 15089 198803 15091 198805 100
  l 15096 198806 15170 198880 76
  l 15171 198888 15187 198904 94
  l 15192 198905 15202 198915 64
  l 15206 198916 15229 198939 50
  l 15231 198940 15242 198951 83
  l 15246 198952 15259 198965 79
  l 15264 198966 15269 198971 50
  l 15286 198972 15307 198993 86
  l 15309 198994 15380 199065 69
  l 15381 199068 15405 199092 76
  l 15411 199093 15444 199126 76
  l 15445 199128 15461 199144 65
  l 15462 199146 15540 199224 67
  l 15546 199225 15635 199314 70
  l 15641 199315 15646 199320 100
  l 15647 199324 15678 199355 63
  l 15681 199356 15707 199382 78
  l 15719 199383 15798 199462 63
  l 15801 199463 15815 199477 87
  l 15825 199478 15858 199511 85
  l 15869 199512 15890 199533 77
  l 15905 199534 15916 199545 83
  l 15918 199546 15950 199578 76
  l 15954 199579 15968 199593 73
  l 15972 199594 16000 199622 90
  l 16006 199623 16013 199630 75
  l 16014 199637 16027 199650 71
  l 16028 199653 16079 199704 71
  l 16080 199709 16093 199722 57
  l 16094 199724 16127 199757 62
}
a {
  s 49489
  b 17135 200810
  e 18198 201881
  l 17135 200810 17183 200858 65
  l 17184 200876 17331 201023 80
  l 17338 201024 17438 201124 80
  l 17440 201125 17484 201169 62
  l 17485 201180 17524 201219 93
  l 17525 201222 17577 201274 72
  l 17579 201275 17601 201297 70
  l 17602 201300 17685 201383 83
  l 17687 201384 17701 201398 100
  l 17719 201399 17760 201440 86
  l 17761 201442 17881 201562 75
  l 17886 201563 17893 201570 75
  l 17895 201571 17916 201592 73
  l 17917 201597 17944 201624 71
  l 17948 201625 17969 201646 95
  l 17970 201648 18057 201735 82
  l 18058 201740 18094 201776 81
  l 18097 201777 18101 201781 100
  l 18103 201782 18123 201802 67
  l 18124 201804 18161 201841 79
  l 18162 201845 18198 201881 68
}
a {
  s 3308
  b 18617 202636
  e 18670 202689
  l 18617 202636 18670 202689 80
}
a {
  s 10909
  b 19132 203321
  e 19421 203603
  l 19132 203321 19181 203370 68
  l 19182 203374 19192 203384 73
  l 19199 203385 19239 203425 73
  l 19241 203426 19299 203484 71
  l 19303 203485 19421 203603 70
}
a {
  s 11306
  b 22009 208042
  e 22355 208360
  l 22009 208042 22135 208168 72
  l 22138 208169 22154 208185 82
  l 22168 208186 22171 208189 75
  l 22173 208190 22212 208229 70
  l 22215 208230 22246 208261 69
  l 22255 208262 22267 208274 77
  l 22280 208275 22292 208287 92
  l 22293 208293 22327 208327 86
  l 22328 208333 22355 208360 79
}
a {
  s 5916
  b 22352 208814
  e 22746 209195
  l 22352 208814 22384 208846 76
  l 22387 208847 22393 208853 71
  l 22396 208854 22408 208866 62
  l 22409 208868 22427 208886 84
  l 22430 208887 22440 208897 73
  l 22442 208898 22461 208917 85
  l 22462 208931 22500 208969 56
  l 22502 208970 22526 208994 88
  l 22571 208995 22571 208995 100
  l 22572 209041 22598 209067 67
  l 22601 209068 22610 209077 50
  l 22611 209079 22692 209160 68
  l 22705 209161 22711 209167 57
  l 22719 209168 22746 209195 68
}
a {
  s 19397
  b 25719 213796
  e 26175 214243
  l 25719 213796 25735 213812 71
  l 25738 213813 25770 213845 67
  l 25771 213847 25892 213968 67
  l 25897 213969 25928 214000 81
  l 25931 214001 25935 214005 80
  l 25936 214007 25990 214061 75
  l 25991 214063 26131 214203 77
  l 26135 214204 26155 214224 67
  l 26157 214225 26175 214243 84
}
a {
  s 28877
  b 26162 214589
  e 26978 215378
  l 26162 214589 26191 214618 57
  l 26192 214620 26201 214629 80
  l 26203 214630 26227 214654 60
  l 26228 214659 26267 214698 55
  l 26272 214699 26301 214728 63
  l 26303 214729 26338 214764 64
  l 26340 214765 26372 214797 73
  l 26377 214798 26395 214816 58
  l 26396 214818 26401 214823 67
  l 26404 214824 26439 214859 75
  l 26440 214864 26446 214870 86
  l 26454 214871 26468 214885 67
  l 26474 214886 26501 214913 57
  l 26507 214914 26515 214922 78
  l 26517 214923 26549 214955 79
  l 26553 214956 26556 214959 75
  l 26558 214960 26609 215011 75
  l 26611 215012 26872 215273 82
  l 26873 215275 26914 215316 71
  l 26917 215317 26953 215353 62
  l 26955 215354 26962 215361 88
  l 26963 215363 26978 215378 56
}
a {
  s 15201
  b 30643 219104
  e 31175 219595
  l 30643 219104 30655 219116 77
  l 30658 219117 30713 219172 63
  l 30731 219173 30735 219177 80
  l 30750 219178 30821 219249 60
  l 30826 219250 30857 219281 66
  l 30858 219292 30910 219344 66
  l 30911 219346 30919 219354 89
  l 30921 219355 30990 219424 69
  l 30994 219425 31055 219486 74
  l 31064 219487 31095 219518 78
  l 31098 219519 31138 219559 71
  l 31140 219560 31175 219595 72
}
a {
  s 74742
  b 33717 225638
  e 35155 227058
  l 33717 225638 33739 225660 83
  l 33740 225662 33758 225680 79
  l 33760 225681 33801 225722 76
  l 33802 225724 33886 225808 76
  l 33887 225811 33907 225831 81
  l 33910 225832 33925 225847 56
  l 33932 225848 33958 225874 67
  l 33959 225876 34054 225971 91
  l 34055 225973 34200 226118 81
  l 34201 226120 34230 226149 77
  l 34232 226150 34255 226173 63
  l 34257 226174 34275 226192 79
  l 34295 226193 34325 226223 81
  l 34326 226225 34376 226275 84
  l 34377 226282 34427 226332 61
  l 34431 226333 34552 226454 83
  l 34554 226455 34572 226473 89
  l 34573 226475 34600 226502 86
  l 34602 226503 34868 226769 87
  l 34926 226770 34928 226772 33
  l 34929 226835 34963 226869 77
  l 34967 226870 35128 227031 90
  l 35132 227032 35136 227036 80
  l 35137 227040 35155 227058 84
}
a {
  s 22220
  b 48625 243912
  e 49354 244595
  l 48625 243912 48747 244034 63
  l 48749 244035 48908 244194 89
  l 48910 244195 48934 244219 80
  l 48935 244231 48945 244241 64
  l 48948 244242 48976 244270 66
  l 48985 244271 49010 244296 42
  l 49014 244297 49048 244331 71
  l 49049 244334 49069 244354 57
  l 49070 244356 49080 244366 64
  l 49085 244367 49122 244404 74
  l 49124 244405 49162 244443 56
  l 49165 244444 49175 244454 91
  l 49176 244458 49186 244468 55
  l 49189 244469 49202 244482 64
  l 49247 244483 49250 244486 75
  l 49251 244488 49264 244501 64
  l 49265 244503 49276 244514 75
  l 49277 244527 49303 244553 67
  l 49313 244554 49354 244595 76
}
a {
  s 21463
  b 52059 253371
  e 52726 254026
  l 52059 253371 52167 253479 57
  l 52168 253482 52178 253492 64
  l 52180 253493 52329 253642 71
  l 52330 253650 52364 253684 54
  l 52366 253685 52440 253759 77
  l 52441 253761 52498 253818 79
  l 52499 253820 52570 253891 72
  l 52579 253892 52583 253896 100
  l 52597 253897 52649 253949 62
  l 52650 253951 52661 253962 83
  l 52663 253963 52726 254026 55
}
a {
  s 4419
  b 52770 254689
  e 52901 254809
  l 52770 254689 52789 254708 85
  l 52801 254709 52901 254809 67
}
a {
  s 21954
  b 64975 261376
  e 65727 262130
  l 64975 261376 64998 261399 67
  l 65002 261400 65023 261421 68
  l 65027 261422 65073 261468 70
  l 65074 261482 65150 261558 74
  l 65158 261559 65171 261572 86
  l 65176 261573 65225 261622 66
  l 65229 261623 65233 261627 60
  l 65236 261628 65297 261689 81
  l 65299 261690 65329 261720 71
  l 65334 261721 65357 261744 67
  l 65358 261746 65486 261874 70
  l 65488 261875 65513 261900 69
  l 65515 261901 65551 261937 51
  l 65554 261938 65559 261943 83
  l 65563 261944 65585 261966 65
  l 65589 261967 65596 261974 75
  l 65597 261985 65627 262015 87
  l 65628 262050 65636 262058 56
  l 65646 262059 65659 262072 71
  l 65666 262073 65698 262105 79
  l 65704 262106 65711 262113 88
  l 65712 262115 65727 262130 88
}
a {
  s 6769
  b 72075 268797
  e 72254 268973
  l 72075 268797 72163 268885 67
  l 72167 268886 72193 268912 78
  l 72194 268914 72215 268935 64
  l 72217 268936 72254 268973 74
}
a {
  s 32873
  b 81270 276397
  e 82246 277489
  l 81270 276397 81275 276402 100
  l 81276 276405 81338 276467 68
  l 81339 276474 81367 276502 59
  l 81368 276509 81399 276540 53
  l 81401 276541 81409 276549 67
  l 81417 276550 81480 276613 77
  l 81482 276614 81496 276628 73
  l 81497 276635 81529 276667 76
  l 81530 276669 81550 276689 48
  l 81552 276690 81554 276692 100
  l 81559 276693 81571 276705 69
  l 81574 276706 81601 276733 61
  l 81607 276734 81618 276745 92
  l 81643 276746 81927 277030 85
  l 81928 277194 81932 277198 60
  l 81944 277199 81982 277237 72
  l 81983 277250 82001 277268 74
  l 82014 277269 82070 277325 74
  l 82072 277326 82079 277333 75
  l 82085 277334 82120 277369 75
  l 82124 277370 82210 277456 69
  l 82215 277457 82233 277475 63
  l 82234 277477 82246 277489 85
}
a {
  s 4223
  b 82830 278869
  e 82916 278955
  l 82830 278869 82916 278955 70
}
a {
  s 20252
  b 83641 280749
  e 84443 281443
  l 83641 280749 83659 280767 84
  l 83662 280768 83688 280794 78
  l 83693 280795 83710 280812 56
  l 83740 280813 83759 280832 60
  l 83760 280834 83884 280958 80
  l 83885 280983 83885 280983 100
  l 83910 280984 83940 281014 81
  l 83942 281015 84003 281076 68
  l 84005 281077 84044 281116 73
  l 84049 281117 84064 281132 56
  l 84066 281133 84080 281147 87
  l 84082 281148 84097 281163 69
  l 84099 281164 84145 281210 85
  l 84146 281212 84251 281317 58
  l 84271 281318 84281 281328 91
  l 84303 281329 84306 281332 100
  l 84309 281333 84316 281340 88
  l 84318 281341 84322 281345 80
  l 84341 281346 84367 281372 70
  l 84371 281373 84379 281381 78
  l 84384 281382 84399 281397 69
  l 84401 281398 84425 281422 68
  l 84426 281426 84443 281443 67
}
x {
  n 0
}
#:lav
s {
  "seq1" 1 86981 0 1
  "seq2-" 1 379801 1 1
}
h {
   "> seq1"
   "> seq2 (reverse complement)"
}
a {
  s 5042
  b 47829 138144
  e 47928 138244
  l 47829 138144 47896 138211 84
  l 47899 138212 47915 138228 65
  l 47916 138232 47928 138244 77
}
x {
  n 0
}
m {
  n 0
}
#:eof